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由于钟木源工作认真负责，一年后(1946年) 组织上委任他任东江纵队第二支队龙(川)河(源)紫(金)五(华)兴(宁)交通站负责人，参与组建川南游击大队，1947年后为站长，并光荣地加入中国共产党。
1948年3月5日，龙川县国民党自卫总队长黄道仁纠集鹤市联防队长张佩珊，准备在川南游击区进行大扫荡，妄图一举消灭川南游击队。钟木源同志从伪乡长张日华那里弄来情报，送给川南游击队领导黄克同志，使川南游击队及时得到情报，有充分的时间做好战斗准备，并组织各村民兵的共同配合，埋伏在紫市至增江布各山头制高点，进行阻击战，又得龙河大队长张惠民率100多人枪，一天打退了敌人七次疯狂的进攻，配合对敌激战一天，计毙敌10余人，缴获步枪三支，子弹200余发。
由于该村武装斗争活跃，遭到敌人残酷的洗劫。1948年4月，黄道仁率匪军400余人，先后两次对游击活动区增新村进行血腥围剿，川南游击队员钟才球、钟玉才、钟成妹突围时被捕遭杀害，罗志廷等10余人被监禁，钟木源、罗日扬、钟子金等游击队员家被抢劫一空。