黄居仁和周文雍及时向青年团广州地方委员会汇报了学校的情况，认为校长萧冠英实行独裁，目的就是反对孙中山先生的三大政策，反对学生革命,决定要组织学生抗议其行为。青年团广州地委指示要利用这个事件，开展反对国民党右派的斗争。在青年团广州地委的大力支持下，黄居仁和周文雍回学校，召集青年团员和“新学生社”成员开会，确定和校长萧冠

英进行坚决斗争，并且秘密组织学校进步教工和学生一起，查出萧冠英有贪污校款的行为。黄居仁带领进步学生直接找萧冠英，指出其把学生编为一个团，实行军事化管理，是法西斯主义教育。萧冠英辩解是为了管理好学生，让学生学习到更加多的知识，说的冠冕堂皇。黄居仁又把萧冠英贪污校款的事实摆出来，理直气壮地问:“这样也是为 了我们学生好，学习到更加多的知识吗?”萧冠英不知道黄居仁已经查到自己贪污校款事情，面对质问，无言可对，只是拒不承认。但是，还是作了让步，宣布解散军事编制，不进行军事化管理，恢复学校原来的状况。

自此以后，校长萧冠英认为黄居仁当众揭发了自己贪污校款的事，使自己难堪，对黄居仁怀恨在心，将其视为眼中钉，一直想找借口整治黄居仁。由于黄居仁经常到青年团广州地委和新学生总社参加会议，在学校组织学生活动。萧冠英以黄居仁“好惹是非、反对校长、无心读书、不堪造就、无可救药”为名，于1924年秋开除了黄居仁学籍。中共广东区委和社会主义青年团广州地委及时指出，这是国民党右派对国民革命积极分子的打击报复，并且鼓励黄居仁不要被反动势力的嚣张气焰吓倒，要走向社会，积极进行斗争，决定安排黄居仁到青年团广州地委专门做青年学生的工作。黄居仁在青年团广州地委工作-个多月后，基本熟悉了工作程序和大多数青年团支部的情况。

10月17日，黄居仁回到家乡，根据家族长辈和母亲的安排，和讴田村姑娘戴三妹完婚，家族按照当地风俗习惯，为他们举办了隆重迎娶仪式。婚后第三天，妻子戴三妹依照当地风俗，返回娘家，黄居仁告别新婚妻子和母亲，离开家乡，到广州市区从事革命工作。