3月23日，共青团广东区委原准备派黄居仁到广西梧州发展共青团组织,建立共青团梧州地委。但是,由于发生中山舰事件，而黄居仁一直负责秘密和黄埔军校的共产党和共青团组织联系，为处理好中山舰事件，反击蒋介石的进攻,中共广东区委决定，由共青团广东区委书记杨善集去广西梧州组织建立共青团梧州地委，黄居仁代理共青团广东区委书记。

杨善集离开广州后,黄居仁的主要工作是和中共广东区委其它委员一起正确处理中山舰事件,筹备召开省港青年工人大会和省港女工大会。黄居仁和共青团广东区委沈宝同、马英、李耀先、陈志文、区梦觉、郭寿华等分头到各工厂、码头和省港罢工青年中去组织动员,并且发动粤汉、广三铁路的青年工人代表，沙面洋务青年工人代表具体负责筹备工作。共青团区委妇委书记区梦觉配合蔡畅具体负责省港女工大会筹备工作。

3月28日,在黄居仁为代理书记的共青团广东区委的直接领导下,省港青年工人大会在广东省教育会礼堂召开。省港两地青年工人共1000多青年到会,黄居仁以中共广东区委青年运动委员会书记、共青团广东区委书记的名义主持大会，全国总工会代表刘少奇、共青团代表周文雍、工人代表会刘尔崧、罢工委员会代表苏兆征等先后发表了演说。大会通过了拥护省港大罢工、保护青年工人利益、参加广州工人代表大会等提案，最后发表《省港青年工人大会宣言》，呼吁各界群众拥护国民政府，督促国民政府北伐。

3月30日，在中共广东区委和共青团广东区委黄居仁的直接组织领导下，省港女工大会在国民党中央党部礼堂召开,到会有印务、海员、电话、女司机、广州洋务等40余个女工团体,共1500多女工。大会一致通过了制定新工厂法、女工保护法、省港罢工等3个提案，并决定选派女工代表10人参加广州工人代表大会,以便提出妇女本身利益之要求。会议以后,黄居仁于4月8日以共青团粤区委名义给共青团中央写了报告《召开省港女工大会经过》。

3月31日，黄居仁在《广东青年》发表关于中国国民革命与当前阶级斗争的理论文章《国民革命与阶级斗争》,这是黄居仁根据中国革命具体情况写的。