纪律是执行政策的保证。黄居仁对组织建设的基本措施，是有计划地加强团员、青年进行有关组织、政策工作的训练。他针对当时团员、青年做工作多有凭主观和喜欢个人自由出发，不肯恪守团体纪律的情况，以时任团广州地委学生自治会主任郭某某违纪的典型事例，对他们进行纪律教育。.郭某因团中央调其往团汕头地委工作，他乘调动工作之机，擅自回家省亲20多天而不向团组织汇报。团中央催他速去赴任视事，他亦一再拖延两周后才动身。同时，在非党团人员面前还趾高气扬，以共产党员自居，说我是“c·P”(共产党的英文缩写)，怎么呢?为此，团粤区委给他“留团察看半年处分”的决定，并及时向中央报告。而团中央认为，郭负有重要工作，可由“留团察看改为警告”。黄居仁则再次亲笔致函团中央(1925年8月21日)，他坚持:领导同志违纪，同样应受纪律处分。同时，还直言道:“团体的纪律不应以负重要工作之同志而姑息”。而他自己却凡事以身作则，严于律已，堪称执行团体纪律的楷模。而他这一“不唯上而唯实”的精神，为广大团员、青年所称颂。

然而，他在负贲团区委的领导工作中，也曾有过一些缺点和失误，但他能主动解剖自己，勇于承担责任，给其他领导人树立了榜样。如开展学运时，广州教会学校“圣三一中学”和广东大学等校人员，常有与该校团组织、新学生社发生冲突现象。他已充分认识到主要是团区委负责学运的干部，工作不够深入,大有脱离群众的表现。为此，他主动向团中央报告(1926年4月24日)，如实反映广州学运的不良状况，并分析检查了他本人和有关团组织的工作失误及其原因。由于他勇于正视自己，善于总结经验教训,深得广大团员信任，以至他能较长时间地连选连任团广东区委主要领导人。历史证明，他在任期间的团广东区委，成为中共广东区委得力助手和可靠的后备军。